Dok i centrifugalni i aksijalni ventilatori pokreću zrak, oni su dizajnirani za različite operativne potrebe. Aksijalni ventilatori pokreću velike količine zraka pri niskom pritisku, što ih čini pogodnim za jednostavne ventilacijske zadatke gdje zrak slobodno struji. Centrifugalni ventilatori su, naprotiv, napravljeni za primjene visokog-pritiska gdje zrak mora proći kroz kanale, filtere ili druge prepreke. Sposobnost centrifugalnog ventilatora da stvara pritisak znači da može održavati protok zraka čak i kada je suočen sa otporom, zadatkom koji bi uzrokovao zaustavljanje aksijalnog ventilatora ili gubitak efikasnosti.
Konstrukcija ova dva tipa takođe se značajno razlikuje. Centrifugalni ventilatori su glomazniji, sa spiralnim kućištem i radijalnim impelerom, dok su aksijalni ventilatori kompaktni, sa lopaticom u stilu propelera-u cilindričnom kućištu. Ova razlika utiče na instalaciju i održavanje: centrifugalni ventilatori zahtijevaju više prostora, ali su lakši za servisiranje u sistemima visokog{3}}pritiska. Nivoi buke su još jedna ključna razlika; centrifugalni ventilatori imaju tendenciju da budu tiši od aksijalnih ventilatora pri ekvivalentnim brzinama protoka zraka, što ih čini poželjnijim za primjenu u zatvorenom prostoru. Za industrijske procese koji uključuju sakupljanje prašine, usisavanje dima ili složene kanale, centrifugalni ventilatori nude nivo performansi i pouzdanosti koji aksijalni ventilatori ne mogu dostići.

